ProtoThickBox は jQuery のアドオンである ThickBox を prototype.js （1.6以降）で動作するように移植したものです。
オリジナルの ThickBox と100%互換性があり、置き換えるだけで動作します。

デモ（オリジナルの ThickBox）を見るには以下のリンクをクリックして下さい。
デモ（オリジナルのデモページ）

1. jquery.js + thickbox.js が動作している状態で、jquery.js を prototype.js + effects.js で置き換えます。
2. thickbox.js を protothickbox.js で置き換えます。
3. thickbox.css はそのまま利用できます。